董卓死后，随后牛辅也被杀，王允开始以诛杀国贼的首要功臣自居，在如何安排和处理他的旧部时，反复无常，态度极不慎重，他先是想全部赦免董卓的部下，可继而又对群臣解释说：“本来，他们是没有罪的，只是身不由己，跟随董卓，所以不得已听从董卓差遣，犯了错误。现在如果给他们突然加上恶逆的罪名，而且特定赦免他们，恐怕反而使他们猜疑恐惧，心理承受不了，所以，赦免他们无罪不是使他们安心的上上之策，还不如让他们承受惩罚。”
凉州兵是董卓的嫡系部队，战斗力强，而且对董卓最忠心。董卓死后，如何处置凉州兵，是关系王允本人和东汉政权的大事。王允企图削夺凉州兵将领的兵权，取缔全部凉州兵，并且计划利用关东兵去控制他们。
可是后来有人对王允说：“凉州兵素来害怕雷云，畏惧关东兵，而今，如果派关东兵去解散他们，凉州兵人人都会担心性命不保，这样，很容易引起兵变和混乱。还不如任命皇甫义真为将军，去担任凉州兵的统帅，并让他长期留在那儿，以便安抚军心。”
王允坚决反对：“这样绝对不行，关东兵是反董卓的义兵，与我们是同一条路线，现在董卓已死，如果继续把他们屯驻在险恶之地，虽然安抚了凉州兵，但是关东兵将领会疑心我们不重视他们。”
凉州百姓听到王允想解散凉州兵的风声后，便到处传言，说王允要杀掉所有凉州人，一时之间，整个凉州人心惶惶，一片惊慌。凉州兵将领本来就成了惊弓之鸟，对自己的前途深感忧虑，当他们得知王允要削夺他们的军权，解散凉州兵的消息后，更是惊慌。绝望的凉州兵寻思：反正是一死，不如死个痛快。于是他们迅速召集军队，严阵以待，准备见机起事，并且互相传告：王允不仅没有丝毫赦免的意思，反而想剥夺我们的兵权，置我们于死地。我们除了联合起来，别无选择。
当时，凉州军中李傕等人归来时无所依托，本欲解散部队逃归家乡，又怕仍得不到赦免，而凉州军最有影响和实力的将领是李傕和郭汜，李儒找到了他们说道：“听长安人议论说欲诛尽凉州人，各位如果弃军单行，则一个小小的亭长就能抓住你们了。不如率军东进，攻打长安，为董卓报仇。事情如果成功了，则奉国家以正天下；如果不成功，再走也不迟。”
李傕等人采纳了李儒的建议，到处说：“朝廷不赦免我们，我们应当拼死作战。如果攻克长安，则得天下了；攻不下，则抢夺三辅的妇女财物，西归故乡，还可以保命。”
部下纷纷响应，于是同郭汜、张济等人结盟，率军几千人，日夜兼程，攻向长安。
王允听说后，派董卓旧部将领胡轸在新丰迎击李傕，胡轸率部投降。李傕沿途收集部队，他们将所有凉州兵集合起来，誓师进发都城长安，到达长安时已有十余万人。
四月八日东汉官兵不堪一击，不久，李傕、郭汜的部队便攻陷长安。城陷后，与吕布展开巷战，吕布虽然勇猛，但是好虎架不过一群狼，更何况他这只老虎带着一群绵羊和一群狼作战，他的军队被李傕、郭汜的军队冲散，吕布无奈只好慌忙领兵出逃，在青锁门停住，招呼王允一同逃走。
王允断然拒绝，对吕布说：“如果天子祖先在天有灵，能赐福社稷，保佑我们的国家平安无事，我就心满意足了。如果这一愿不能实现，我愿意献出自己的生命，以死来报效朝廷。皇上年纪幼小，少不更事，只能靠我们来辅助他。国家遭受如此灾难，如果弃下皇上，只顾自己逃命，我实在是不忍心。况且，我身为宰相，不仅不能使国家平安无事，反而导致逆贼的反叛，我的责任重大啊!请你出城以后，多多鼓励关东豪杰，要常常念及皇上!”说完，便扶着皇帝逃到宣平城楼。
李傕、郭汜追到宣平门下，叩头便拜。汉献帝壮起胆子询问道：“你们目无王法，作乱京城，到底打算作什么？”
李傕回答说：“董太师对陛下忠心耿耿，却无缘无故遭人杀害，我们只想替太师讨回公道，不敢造反。等到捉拿处决凶手后，我们愿意接受审判。”
王允哈哈乐道：“你们这些奸贼，一心助纣为虐，哈哈哈，你以为我会相信你们么？”
这时候李儒从人群中站了出来对王允说道：“王司徒，你不相信他们也应该相信我吧？我替他们担保如何？”
王允想了一想，便向汉献帝行了最后的君臣大礼，便随士兵走下了城楼，李傕、郭汜命令手下当场将王允处决。
王允死后，李儒来到王允的尸体前面无表情的说道：“对不起，我第一次说谎了，我骗了你，但是我保证，皇帝会活得好好的。哈哈哈~！没办法，谁让你杀了我的女人和孩子？来人，将王允全家抄家灭族。”
王允等人遇害以后。李傕等人纵兵劫掠，百姓、官员死伤不计其数。
李傕等人占领长安，挟持汉献帝封李傕为扬武将军，郭汜为扬烈将军，樊稠等人皆为中郎将。因为害怕雷云趁这个时机率兵攻打他，所以以天子的名义风雷云为骠骑将军。诏太傅马日磾、太仆赵岐杖节镇抚关东。
雷云在董卓死后没有率兵攻打长安，而是继续举办婚礼，和平常一样忙一些无聊的公务。
这次的婚礼，和平时人们想象的不一样，是一个有一点西式的现代婚礼。一切的程序都是萧天安排的，没办法因为只有他的脑子里边装的东西多。
剩下的那些留下来参观的诸侯使者和一些人大部分都对这种婚礼很好奇，当雷云跪下来求婚的时候很多人的脸上都有一种很那个的表情。
婚礼仪式结束以后，婚宴上很多人都好奇地问雷云的这种婚礼是怎么想出来的？大部分人都认为他这种婚礼不合礼法。雷云也懒得解释，就把解释的问题交给了萧天。